Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm1Q60636 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms