Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2f1Q60632 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms