Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xrcc1Q60596 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms