Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sin3aQ60520 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sin3aQ60520 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms