Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myh1Q5SX40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms