Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf215Q5SPX3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms