Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rtp3Q5QGU6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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