Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3kQ5GIG6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3kQ5GIG6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms