Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2f8Q58FA4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2f8Q58FA4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms