Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prune2Q52KR3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms