Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnl1Q52KE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccnl1Q52KE7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms