Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brinp3Q499E0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brinp3Q499E0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brinp3Q499E0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms