Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt35Q497I4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms