Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnah12Q3V0Q1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms