Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rimbp3Q3V0F0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rimbp3Q3V0F0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms