Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms