Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms