Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm28047Q3US59 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms