Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms