Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlrc4Q3UP24 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms