Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tmem253Q3UNB8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms