Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r7Q3UM45 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ppp1r7Q3UM45 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms