Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmdn3Q3UJU9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms