Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Greb1Q3UHK3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms