Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfgef3Q3UGY8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms