Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc58Q3UGP9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc58Q3UGP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms