Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc174Q3U155 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms