Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3TTL0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms