Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Calr4Q3TQS0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Calr4Q3TQS0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms