Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cwc27Q3TKY6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cwc27Q3TKY6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms