Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smarca4Q3TKT4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca4Q3TKT4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms