Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde12Q3TIU4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde12Q3TIU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms