Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp444Q3TDV8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp444Q3TDV8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms