Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem104Q3TB48 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem104Q3TB48 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms