Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Riiad1Q3KNY5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms