Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tdrd9Q14BI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd9Q14BI7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms