Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ptchd1Q14B62 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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