Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Perm1Q149B8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms