Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VgfQ0VGU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VgfQ0VGU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms