Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4r2Q0VGB7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms