Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim24Q0VG18 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim24Q0VG18 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim24Q0VG18 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim24Q0VG18 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms