Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rundc1Q0VDN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc1Q0VDN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms