Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab42Q0PD08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab42Q0PD08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms