Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn2bQ0KL01 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms