Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnnm1Q0GA42 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms