Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
1700061G19RikQ08EE8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms