Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou6f1Q07916 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou6f1Q07916 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms