Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah1bQ06985 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms