Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emx1Q04742 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms