Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnb1Q03717 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms